引起溃疡性结肠炎的原因至今尚未完全清楚，可能与下列因素有关；
(1)感染因素：
因本病的病理变化和临床表现与细菌性痢疾非常相似，有些病例粪便中能培养出细菌，部分病例应用抗生素有效，因而认为感染是本病的病因。但多年来反复研究还未能直接找到感染微生物学的根据。在溃疡性结肠炎的病人，约有0.5%一8.2%的病人由菌痢转变而来，因此还有人提出可能与自身免疫有关。
(2)精神因素：
由于精神障碍引起植物神经功能失调，随之出现肠道运动亢进、肌肉痉挛、血管收缩、组织缺血、毛细血管通透性增加等，最终导致肠壁炎症及溃疡形成。
(3)遗传因素：
在欧美国家，本病的发病率较高，并有较明显的家族性，种族间的发病率有明显差异，所以有人提出本病可能与遗传有关。
(4)大肠内酶的局部因素：
肠壁分泌过多的溶菌酶、蛋白质分解酶等，破坏了粘液的保护作用，因而导致细菌的侵入，发生粘膜坏死。
(5)过敏反应：
某些食物(如牛奶)可使少数病例病情复发。
(6)防御机能障碍。
(7)自身免疫因素：
由于本病常并发类风湿性关节炎、桥一本氏病、红斑狼疮等自身免疫性疾病，应用肾上腺皮质激素或其它免疫抑制剂治疗有一定效果，因此提示本病很可能为自身免疫性疾病。
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从医50载，孔彪儒教授
杰出贡献之肠炎康复汤 |
孔彪儒，我国著名中医教授，从医50年救人无数。借鉴祖辈世代行医治病经验及现代医学理论和数十年的临床实践，遵循“科研服务临床”的指导思想，经过不断研究—试验—提高—完善，成功研制出治疗结肠炎的特效中药验方——孔氏肠炎康复汤。
中医认为，结肠病多因情之所伤，肝失疏泄，横逆犯脾，导致肝脾不和；或过食肥甘，损伤脾胃；或素为湿热内蕴之体，复因饮食生冷；或感受署湿之邪，再伤于脾，均使脾之运化失常，水湿内生，郁而化热，湿热壅结大肠，腑气不利、气血凝滞、壅而无脓。本病病位在肠，但与肝、脾、肾功能失调关系密切。因此在治疗方面，如果仅针对肠道进行治疗，可能对近期症状缓解有一定帮助，但对疾病的彻底康复上，无任何帮助，使患者走上好转－复发，再好转－再复发的道路.....
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